我院病理科始建于1966年，占地面积约1000余平方米（其中常规病理占地面积约760平方，分子病理实验室占地面积约300平方）。开展常规病理诊断、细胞病理诊断、术中快速冰冻病理诊断、疑难病理会诊、远程病理会诊等服务项目。除常规开展特殊染色、免疫组织化学外，还开展了分子病理相关检查，如胸部肿瘤FISH分子遗传学、结核及肺癌相关分子病理PCR检测等关键技术。现有设备较为先进，包括罗氏全自动免疫组化仪、杂交仪、徕卡荧光显微镜、莱卡生物显微镜、冰冻切片机、全封闭自动脱水机、全自动细胞检测制备仪、微标本-细胞学蜡块制备仪、麦克奥迪数字化扫描系统、全自动核酸提取仪、超微量紫外可见光光度仪、实时荧光定量PCR仪等先进设备。

我院病理科在胸部疾病病理诊断经验丰富，尤其在结核病、肺癌、肺部涎腺肿瘤、胸腺瘤、间皮瘤以及间质性肺疾病等肺部各类疾病的诊断与鉴别诊断方面具有专业特长，在全国肺部疾病病理学诊断处于先进水平。